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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
12/11/2015 |
Actualizado : |
28/10/2019 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; RUBIO, L.; BERTALMIO, A.; MAESO, D.; RIVAS, F.; COLINA, R. |
Afiliación : |
MARÍA JOSÉ BENÍTEZ-GALEANO, Universidad de la República (UdelaR)/ Centro Universitario Regional Noroeste, Salto (CENUR); LETICIA PAOLA RUBIO CATTANI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DIEGO CESAR MAESO TOZZI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CARLOS FERNANDO RIVAS GRELA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RODNEY COLINA, Universidad de la República (UdelaR)/ Centro Universitario Regional Noroeste, Salto (CENUR). |
Título : |
Phylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage. |
Fecha de publicación : |
2015 |
Fuente / Imprenta : |
Viruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS. |
ISSN : |
1999-4915 |
DOI : |
10.3390/v7072814 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015. |
Contenido : |
ABSTRACT.
Citrus Tristeza Virus (CTV) is the most economically important virus of citrus worldwide. Genetic diversity and population structure of CTV isolates from all citrus growing areas from Uruguay were analyzed by RT-PCR and cloning of the three RNA silencing suppressor genes (p25, p20 and p23). Bayesian phylogenetic analysis revealed the circulation of three known genotypes (VT, T3, T36) in the country, and the presence of a new genetic lineage composed by isolates from around the world, mainly from South America. Nucleotide and amino acid identity values for this new genetic lineage were both higher than 97% for the three analyzed regions. Due to incongruent phylogenetic relationships, recombination analysis was performed using Genetic Algorithms for Recombination Detection (GARD) and SimPlot software. Recombination events between previously described CTV isolates were detected. High intra-sample variation was found, confirming the co-existence of different genotypes into the same plant. This is the first report describing: (1) the genetic diversity of Uruguayan CTV isolates circulating in the country and (2) the circulation of a novel CTV genetic lineage, highly present in the South American region. This information may provide assistance to develop an effective cross-protection program. |
Palabras claves : |
CITRUS TRISTEZA VIRUS; RT-PCR. |
Thesagro : |
CITRUS; CRUZAMIENTO INTERCROMOSOMICO; FILOGENIA; RECOMBINACION; URUGUAY. |
Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/5167/1/Rivas-F.-Maeso-D.-2015.-Viruses.pdf
http://www.mdpi.com/1999-4915/7/7/2814
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Marc : |
LEADER 02270nam a2200289 a 4500 001 1053851 005 2019-10-28 008 2015 bl uuuu u0uu1 u #d 022 $a1999-4915 024 7 $a10.3390/v7072814$2DOI 100 1 $aBENÍTEZ-GALEANO, M.J. 245 $aPhylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage.$h[electronic resource] 260 $aViruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS.$c4168 500 $aArticle history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015. 520 $aABSTRACT. Citrus Tristeza Virus (CTV) is the most economically important virus of citrus worldwide. Genetic diversity and population structure of CTV isolates from all citrus growing areas from Uruguay were analyzed by RT-PCR and cloning of the three RNA silencing suppressor genes (p25, p20 and p23). Bayesian phylogenetic analysis revealed the circulation of three known genotypes (VT, T3, T36) in the country, and the presence of a new genetic lineage composed by isolates from around the world, mainly from South America. Nucleotide and amino acid identity values for this new genetic lineage were both higher than 97% for the three analyzed regions. Due to incongruent phylogenetic relationships, recombination analysis was performed using Genetic Algorithms for Recombination Detection (GARD) and SimPlot software. Recombination events between previously described CTV isolates were detected. High intra-sample variation was found, confirming the co-existence of different genotypes into the same plant. This is the first report describing: (1) the genetic diversity of Uruguayan CTV isolates circulating in the country and (2) the circulation of a novel CTV genetic lineage, highly present in the South American region. This information may provide assistance to develop an effective cross-protection program. 650 $aCITRUS 650 $aCRUZAMIENTO INTERCROMOSOMICO 650 $aFILOGENIA 650 $aRECOMBINACION 650 $aURUGUAY 653 $aCITRUS TRISTEZA VIRUS 653 $aRT-PCR 700 1 $aRUBIO, L. 700 1 $aBERTALMIO, A. 700 1 $aMAESO, D. 700 1 $aRIVAS, F. 700 1 $aCOLINA, R.
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INIA Las Brujas (LB) |
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Registros recuperados : 40 | |
1. | | FERNÁNDEZ ,S.; FRAGA, M.; CASTELLS, M.; COLINA, R.; ZUNINO,P. Effect of the administration of Lactobacillus spp. strains on neonatal diarrhoea, immune parameters and pathogen abundance in pre-weaned calves. Beneficial Microbes, 1 September 2020, Volume 11, Issue 5, Pages 477-488. Doi: https://doi.org/10.3920/BM2019.0167Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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2. | | RUBIO, L.; BERTALMIO, A.; RIVAS, F.; COLINA, R.; BENÍTEZ, M. J.; MAESO, D. Caracterización molecular y biológica de aislamientos de campo de CTV de Uruguay y su potencial en la protección cruzada. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Universidad de la República (UdelaR), Facultad de Agronomía. Simposio Nacional, 4. y Congreso Latinoamericano, 1. ?Investigación y Desarrollo Tecnológico en Citrus?, 3-5 noviembre 2014, Montevideo (Uruguay). p. 1-4.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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3. | | BENÍTEZ, M. J.; BERTALMIO, A.; RUBIO, L.; RIVAS, F.; MAESO, D.; COLINA, R. Caracterización molecular y filodinámica del virus de la tristeza de los cítricos. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Universidad de la República (UdelaR), Facultad de Agronomía. Simposio Nacional, 4. y Congreso Latinoamericano, 1. ?Investigación y Desarrollo Tecnológico en Citrus?, 3-5 noviembre 2014, Montevideo (Uruguay). p. 1-4.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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5. | | BOK, M.; VEGA, C.G.; CASTELLS, M.; COLINA, R.; WIGDOROVITZ, A.; PARREÑO, V. Development of an IgY-based treatment to control bovine coronavirus diarrhea in dairy calves. Viruses, 2023, volume 15, issue 3, article 708. OPEN ACCESS. doi: https://doi.org/10.3390/v15030708 Article history: Received 6 February 2023; Revised 5 March 2023; Accepted 6 March 2023; Published 9 March 2023. -- Academic Editor: Tomomi Takano. -- Correspondence author: Bok, M.; INCUINTA, Virology Institute and Technology Innovations,...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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7. | | CAFFARENA, D.; FRAGA, M.; CASTELLS, M.; COLINA, R.; SCHILD, C.; RIET-CORREA, F.; GIANNITTI, F. Detección de agentes causales de diarrea neonatal bovina en 2 tambos de Colonia, Uruguay. In: Jornadas Uruguayas de Buiatría, 44., 2016, Paysandú, UY.; Gianneechini, E.; Elizondo, V. (Ed.).Paysandú: Centro Médico Veterinario de Paysandú/Sociedad Uruguaya de Buiatría, 2016. p. 153-156.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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8. | | BENÍTEZ, M.J.; BERTONI, E.; BERTALMIO, A.; RUBIO, L.; RIVAS, C.; MAESO, D.; COLINA, R. Detección y caracterización de virus y viroides en la Citricultura del Uruguay: aportes sobre el nuevo linaje de CTV en Sudamérica y su repercusión en la protección cruzada. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Citrícola. Resultados de investigación en Citricultura: Genética, Sanidad, Productividad. Salto (Uruguay): INIA, 2015. p. 107-112 (Serie Actividades de Difusión; 752).Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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9. | | RUBIO, L.; HERNÁNDEZ, L.; BENÍTEZ, M. J.; ARRUABARRENA, A.; RIVAS, F.; COLINA, R.; MAESO, D. Biological and molecular characterization of Uruguayan citrus tristeza virus field isolates. Journal of Plant Pathology, 2019, volume 101, Issue 1, pages 97-105. Article history: Received 06 June 2018 // Accepted 29 July 2018 // First Online 13 August 2018 // Published 15 February 2019.
Acknowledgements: This research was funded by Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Uruguay...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
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11. | | DONCEL, B.; CASTELLS, M.; MAYA, L.; FRAGA, M.; UZAL, F.A; COLINA, R.; GIANNITTI, F. Encefalitis asociada a astrovirus bovino neurotrópico, ¿una enfermedad subdiagnosticada en Sudamérica?.[Neurotropic bovine astrovirus-associated encephalitis: An underdiagnosed disease in South America?]. Revista Argentina de Microbiologia, Volume 54, Pages 100-105, 2022. OPEN ACCESS. Doi: https://doi.org/10.1016/j.ram.2021.01.00 Article history: Recibido el 15 de julio de 2020/ Aaceptado el 24 de enero de 2021./Disponible en Internet el 18 junio 2021. Autor para correspondencia: Correo electrónico: fgiannitti@inia.org.uy (F. Giannitti). Este trabajo fue...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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12. | | MAISONNAVE, J.; ROSSI, S.; ACOSTA, D.; HERNÁNDEZ, S.; TERZAGHI, A.; PIGNATARO, G.; COLINA, R. Evaluación de técnicas serológicas para el diagnóstico de la fasciolosis animal In: INIA (INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACIÓN AGROPECUARIA); FPTA (FONDO DE PROMOCIÓN DE TECNOLOGÍA AGROPECUARIA). Avances de investigación en sanidad animal. Montevideo (Uruguay): INIA, 2000. p. 39-51 (Serie FPTA-INIA ; 01) Proyecto FPTA 25. Período de ejecución: Oct.,1991-May.,1995Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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13. | | BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; RUBIO, L.; BERTALMIO, A.; MAESO, D.; RIVAS, F.; COLINA, R. Phylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage. Viruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS. Article history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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14. | | MAYA, L.; PUENTES. R.; RIET-CORREA, F.; GIANNITTI, F.; RIVERO, R.; GINNNEECHINI, E.; FURTADO FLORES, E.; COLINA, R. Caracterización genética del virus de la diarrea viral bovina en Uruguay. In: Jornadas Uruguayas de Buiatría, 46., 2018, Paysandú, Uy., Matto, C.; Delpiazzo, R.(Ed.). Trabajos presentados. Paysandú: Centro Médico Veterinario de Paysandú/Sociedad Uruguaya de Buiatría, 2018. p. 183-185.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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15. | | MAESO, D.; RUBIO, L.; BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; HERNÁNDEZ, L.; BERTALMIO, A.; ARRUABARRENA, A.; RIVAS, F.; COLINA, R. Aportes al conocimiento de Citrus tristeza virus en Uruguay. [resumen] In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); INIA Las Brujas; Biotecnología. Jornada de Agrobiotecnología, XI. Encuentro Nacional de REDBIO, III. Jornada técnica. Las Brujas, Canelones (UY): INIA, 2018. p. 12 (Serie Actividades de Difusión; 786)Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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16. | | CASTELLS, M.; CAFFARENA, D.; CASAUX, L.; SCHILD, C.; GIANNITTI, F.; MIÑO, S.; RIET-CORREA, F.; PARREÑO, V.; COLINA, R. Determinación de la prevalencia y variabilidad genética de rotavirus: coronavirus, torovirus, norovirus y astrovirus. In: Jornadas Uruguayas de Buiatría, 46., 2018, Paysandú, Uy., Matto, C.; Delpiazzo, R.(Ed.). Trabajos presentados. Paysandú: Centro Médico Veterinario de Paysandú/Sociedad Uruguaya de Buiatría, 2018. p. 230-233.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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17. | | CASTELLS, M.; SCHILD, C.; CAFFARENA, D.; GIANNITTI, F.; FRAGA, M.; RIET-CORREA, F.; VICTORIA, M.; COLINA, R. Drinking water: a potential vehicle for rotavirus transmission in neonate calves. In: LATIN AMERICAN SYMPOSIUM OF ENVIRONMENTAL VIROLOGY, 3a.,Salta, Argentina, 2016.Tipo: Abstracts/Resúmenes |
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18. | | GIANNITTI, F.; CAFFARENA, D.; PESAVENTO, P.; UZAL, F.A.; MAYA, L.; FRAGA, M.; COLINA, R.; CASTELLS, M. The first case of bovine astrovirus-associated encephalitis in the southern hemisphere (Uruguay), uncovers evidence of viral introduction to the Americas from Europe. Frontiers in Microbiology, volumen 10, Article 1240, 04 June 2019. [OPEN ACCESS].Doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.01240 Article history: Received: 22 March 2019//Accepted: 17 May 2019//Published: 04 June 2019. This work was funded by Grants PL-015 N-15156 from INIA and 158 from the ?Programa de Iniciación a la Investigación 2017? from ?Comisión Sectorial...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
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19. | | HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, L.; BERTALMIO, A.; ARRUABARRENA, A.; RUBIO, L.; RIVAS, F.; BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; COLINA, R.; MAESO, D. First Report of the Citrus tristeza virus Trifoliate Resistance-Breaking (RB) Genotype in "Newhall" Sweet Orange in South America Plant Disease, 2017, v.101 (6), p.1063. (Abstract) DISEASE NOTES: Posted online on 30 Mar 2017.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
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20. | | RUBIO, L.; HERNÁNDEZ, L.; BERTALMIO, A.; ARRUABARRENA, A.; RIVAS, F.; BENÍTEZ, M.J.; COLINA, R.; MAESO, D. Obtención de aislados de Citrus tristeza virus promisorios para protección cruzada en cítricos. [o4]. Bloque 1: Detección y caracterización de plagas y enfermedades. In: Sociedad Uruguaya de Fitopatología Jornada Uruguaya de Fitopatología, 4., Jornada Uruguaya de Protección Vegetal, 2., 1° setiembre, 2017, Montevideo, Uruguay. Libro de resúmenes. Montevideo (UY): Sociedad Uruguay de Fitopatología (SUFIT), 2017. p. 15Tipo: Abstracts/Resúmenes |
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